El departamento es la unidad académica y administrativa a cargo de ofrecer los programas y cursos hacia grados académicos en las diversas disciplinas en el programa diurno y coordina con la División de Educación Continua y Estudios Profesionales los ofrecimientos en los programas nocturnos y sabatinos. Cada departamento está constituido por los profesores e investigadores adscritos al mismo. El director de departamento es el principal funcionario ejecutivo y administrativo de cada departamento.
Los departamentos académicos de la Universidad de Puerto Rico en Cayey se agrupan en tres áreas, como sigue:
Artes
Ciencias Naturales
Escuelas Profesionales
También ofrecen cursos conducentes a certificado los siguientes programas académicos:
Los siguientes proyectos de investigación y programas auxiliares a la docencia complementan la labor de los departamentos:
Los objetivos y programas de estudio de los departamentos, se describen en la sección de Programas Académicos en este catálogo.